2022年9月粤澳合作联席会议上，澳门经科局与广东省科学技术厅在行政长官贺一诚及广东省省长王伟中见证下，签署了《粤澳科技创新交流合作协议》，成立“粤澳科技创新合作专责小组”，以推进粤港澳大湾区国际科技创新中心建设，深化粤澳科技创新交流与合作，当中澳门经科局担任澳方牵头单位。

粤澳科技创新合作专责小组第二次会议于2024年2月在澳门举行，出席会议者包括澳门经科局、科学技术发展基金、教育及青年发展局、澳门大学、澳门科技大学、药物监督管理局、邮电局，以及广东省科学技术厅、广州市南沙区、珠海市科技创新局、横琴粤澳深度合作区经济发展局等代表。会上总结了过去一年小组的工作情况及执行成果、介绍了2024年度的重点工作计划。同时，双方就加强粤澳科研合作、科技资源开放共享、支持创新创业等各项工作进行意见交流。

而在国家科技部支持下，澳门与横琴、珠海三地政府共同建设“中国—葡语系国家科技交流合作中心”，以促进中国与葡语国家在科技创新等领域上的交流合作，协助葡语国家科企“引进来”中国以及中国科企“走出去”海外发展。此外，澳门与珠海合作构建“澳珠产学研创新联盟”，以集聚两地高校、科研机构、科技企业等科技创新产业持分者，完善澳珠产学研合作机制，促进两地科创资源的高效流动，推动科技成果与需求深度对接，加快转移转化，共同提升两地科技创新能力。